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Interkantonale Vereinbarung und Bundesgesetz (HFKG)
Auf Bundesebene unterliegt die HES-SO dem Bundesgesetz über die Förderung der Hochschulen und die Koordination im schweizerischen Hochschulbereich HFKG
Im Rahmen einer neuen Vereinbarung, die von allen Regierungen und Parlamenten der Partnerkantone Bern, Freiburg, Genf, Jura, Neuenburg, Wallis und Waadt ratifiziert wurde, wird die HES-SO ab 2013 neu organisiert.